北領地博物館和美術館最初於1964年規劃建立，原計劃將位於達爾文市中心商務區內的老市政廳（The Old Town Hall）改造為博物館，1974年當老市政廳即將完全被改造成功的時候達爾文市遭遇罕見旋風，破壞了最新改造的博物館大部分建築結構和博物館內的大部分收藏。此後，博物館內大部分剩餘收藏一直散落在市內各大出租的大廈內。
1979年，北領地成為自制領地，政府決定重新建造一座博物館，新博物館於當年開工建設，1981年9月10日正式對外開放，起初命名為北領地藝術與科學博物館（Northern Territory Museum of Arts and Sciences），1993年改為現名。北領地博物館和美術館擁有30000件藝術作品與物質文化作品收藏，是北領地自制區最主要的博物館，這些作品集中反映了當地甚至是東南亞和太平洋地區的風土人情以及文化傳統，是當地最著名的旅游景點之一。
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