臺北醫學大學強調以學生為中心的全人教育，通識與專業並重。2006年起，已連續4年獲得教育部教學卓越計畫補助。2010年更與國家衛生研究院、中央研究院合辦「神經再生博士學位學程」及「癌癥生物學與藥物研發博士學位學程」。「培育兼具人文關懷、社會服務熱忱及國際觀的醫事專業人纔」是北醫的教育宗旨；50年來，北醫人就誕生17位醫療奉獻獎得主，他們無私奉獻社會的精神是全國學子的最佳典范。2010年獲教育部評選為全國二所「通識領航大學」之一。

北醫有87個學生社團，為全國密度最高的學校之一：其中，管絃樂團及杏聲合唱團，多次奪得大專樂團優等獎項；服務性社團每年參與服務同學超過上千人次，屢屢榮獲傑出獎項；在全國性的醫學杯球類賽與大專校院運動會上，成果一樣傲人。

本校學生的申請入學成績，排名居私校第1、2名；在大學評鑒中，為醫學類組中，唯一獲得6項績優的大學。北醫為全國國際標准化最完整的大學，目前已通過品質、環境、溫室氣體、資訊、職業安全（ISO9001、14001、14064-1、27001、OHSAS18001）等國際標准化，是國內第一所通過WHO國際安全學校認證的醫學大學，也是全國率先完成WHO人體實驗認證（FERCAP）的大學。2010年更獲得全國最高品質獎項「第20屆行政院國家品質獎」。


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