蒙古自然史博物館位于蒙古國首都烏蘭巴托，是自然史專門博物館。蒙古自然史博物館原名國家博物館，建于1924年，是蒙古國曆史上最早的博物館。1940年至1941年，蒙古自然史博物館成爲農村研究博物館。1956年，又更名爲國家中心博物館。在1991年蒙古民主化之後，該館更名爲蒙古自然史博物館。
該博物館的原名“國家博物館”同如今烏蘭巴托的另一家博物館蒙古國家博物館的名稱十分相似，而且兩家博物館距離很近。但蒙古國家博物館主要展出蒙古國家曆史以及有關文物，和本博物館的展出內容完全不同。俄國學者 P. K. Kozlov，V. I. Lisovskii，A. D. Simukov，以及美國學者C. Andrews等人的收藏及研究均對本博物館的建館作出了貢獻。本博物館後來成爲其他一些博物館的建館基礎。
本博物館分爲地質、地理、植物和動物、古生物學、人類學部分，涵蓋了蒙古國自然史的各個方面。該館展出的恐龍化石十分知名，其中包括十分完整的特暴龍化石，此外還藏有10多種恐龍蛋化石。
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